Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR1Q13613 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR1Q13613 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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