Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PKD2Q13563 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
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PKD2Q13563 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
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PKD2Q13563 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
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PKD2Q13563 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKD2Q13563 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
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