Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
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