Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAMK2BQ13554 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAMK2BQ13554 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms