Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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