Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PMS2P3Q13401 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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