Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE3BQ13370 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE3BQ13370 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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