Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF5Q13243 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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