Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
GRIN2BQ13224 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
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