Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms