Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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