Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YEL075CYEL075C 369 nt2.49□□□□□ -2.01
USB1Q12208 SNX4YJL036W 1272 nt2.49□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YLR076CYLR076C 423 nt2.49□□□□□ -2.01
USB1Q12208 MED1YPR070W 1701 nt2.48□□□□□ -2.01
USB1Q12208 JIP5YPR169W 1479 nt2.48□□□□□ -2.01
USB1Q12208 HPA3YEL066W 540 nt2.48□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YGR160WYGR160W 612 nt2.48□□□□□ -2.01
USB1Q12208 GCD14YJL125C 1152 nt2.48□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YKR033CYKR033C 426 nt2.48□□□□□ -2.01
USB1Q12208 RPL15AYLR029C 615 nt2.48□□□□□ -2.01
USB1Q12208 MPD2YOL088C 834 nt2.48□□□□□ -2.01
USB1Q12208 MUM2YBR057C 1101 nt2.48□□□□□ -2.01
USB1Q12208 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.48□□□□□ -2.01
USB1Q12208 CDC55YGL190C 1581 nt2.48□□□□□ -2.01
USB1Q12208 ARF1YDL192W 546 nt2.47□□□□□ -2.01
USB1Q12208 RPL23BYER117W 414 nt2.47□□□□□ -2.01
USB1Q12208 PEX14YGL153W 1026 nt2.47□□□□□ -2.01
USB1Q12208 CPR7YJR032W 1182 nt2.47□□□□□ -2.01
USB1Q12208 VMA5YKL080W 1179 nt2.47□□□□□ -2.01
USB1Q12208 MRPS17YMR188C 714 nt2.47□□□□□ -2.01
USB1Q12208 RPL20AYMR242C 519 nt2.47□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YOL024WYOL024W 519 nt2.47□□□□□ -2.01
USB1Q12208 MRP2YPR166C 348 nt2.47□□□□□ -2.01
USB1Q12208 GYP7YDL234C 2241 nt2.47□□□□□ -2.01
USB1Q12208 SWC4YGR002C 1431 nt2.47□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YCL019WYCL019W 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YLR446WYLR446W 1302 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 CWC22YGR278W 1734 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YCR015CYCR015C 954 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RAD55YDR076W 1221 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 AST2YER101C 1293 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 ADH4YGL256W 1149 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YGR017WYGR017W 894 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 PTI1YGR156W 1278 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 MBB1YJL199C 327 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YJR128WYJR128W 360 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RPL8BYLL045C 771 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YPR078CYPR078C 1119 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 SEC27YGL137W 2670 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 CAF120YNL278W 3183 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 UBP14YBR058C 2346 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YKL100CYKL100C 1764 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 ECM21YBL101C 3354 nt2.46□□□□□ -2.02
USB1Q12208 MPS1YDL028C 2295 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 SKP2YNL311C 2292 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 ERG11YHR007C 1593 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RIM1YCR028C-A 408 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 PCL2YDL127W 927 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 CTH1YDR151C 978 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RPC17YJL011C 486 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 MTD1YKR080W 963 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RIM9YMR063W 720 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YSF3YNL138W-A 258 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YNL203CYNL203C 612 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YPL035CYPL035C 348 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 IKI3YLR384C 4050 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 SEC7YDR170C 6030 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 TCB2YNL087W 3537 nt2.45□□□□□ -2.02
USB1Q12208 CBP2YHL038C 1893 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 BNI4YNL233W 2679 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YDL241WYDL241W 372 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YDR491CYDR491C 492 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 PEF1YGR058W 1008 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YHL045WYHL045W 348 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 ATP12YJL180C 978 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 ATG3YNR007C 933 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YNR062CYNR062C 984 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RPS12YOR369C 432 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 AFT2YPL202C 1251 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YPL216WYPL216W 3309 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 MMS1YPR164W 4224 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 CEP3YMR168C 1827 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 UTP14YML093W 2700 nt2.44□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RGR1YLR071C 3249 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 BEM4YPL161C 1902 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YDR209CYDR209C 414 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 HMF1YER057C 390 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 DAD2YKR083C 402 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 SAM37YMR060C 984 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 INP1YMR204C 1263 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 IAH1YOR126C 717 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 GPI2YPL076W 843 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 DBP7YKR024C 2229 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 ESC1YMR219W 4977 nt2.43□□□□□ -2.02
USB1Q12208 ATG13YPR185W 2217 nt2.42□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RSE1YML049C 4086 nt2.42□□□□□ -2.02
USB1Q12208 TOR1YJR066W 7413 nt2.42□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RRP42YDL111C 798 nt2.42□□□□□ -2.02
USB1Q12208 ERP6YGL002W 651 nt2.42□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YLR297WYLR297W 390 nt2.42□□□□□ -2.02
USB1Q12208 COX14YML129C 213 nt2.42□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YBL028CYBL028C 321 nt2.42□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YMR087WYMR087W 855 nt2.42□□□□□ -2.02
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