Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CPSF1Q10570 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
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