Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms