Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM27E3Q08E93 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms