Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACSM1Q08AH1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACSM1Q08AH1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms