Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms