Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOS1Q07889 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOS1Q07889 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOS1Q07889 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOS1Q07889 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SOS1Q07889 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOS1Q07889 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms