Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4BQ07343 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms