Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GABPAQ06546 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms