Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KDSRQ06136 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms