Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	JIP5	YPR169W	1479 nt		3.57	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	PHO88	YBR106W	567 nt		3.57	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	MET10	YFR030W	3108 nt		3.57	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	SWD2	YKL018W	990 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YKR070W	YKR070W	1059 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YLR339C	YLR339C	552 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	SPC2	YML055W	537 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	DLT1	YMR126C	1029 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	RLP7	YNL002C	969 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YSF3	YNL138W-A	258 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YPR077C	YPR077C	372 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	PIN4	YBL051C	2007 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	GCD2	YGR083C	1956 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	PAM1	YDR251W	2493 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	EPL1	YFL024C	2499 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	COM2	YER130C	1332 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	ERG9	YHR190W	1335 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	PCI8	YIL071C	1335 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YLR446W	YLR446W	1302 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	FLO5	YHR211W	3228 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YFR057W	YFR057W	456 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	COX3	Q0275	810 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	LSM1	YJL124C	519 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	IZH2	YOL002C	954 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YOL106W	YOL106W	354 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	VAM10	YOR068C	345 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	SFG1	YOR315W	1041 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	BTS1	YPL069C	1008 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	SET1	YHR119W	3243 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	SNT1	YCR033W	3681 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	SAD1	YFR005C	1347 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	VTC4	YJL012C	2166 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	RRP42	YDL111C	798 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	PPH3	YDR075W	927 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	ECM11	YDR446W	909 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	USE1	YGL098W	738 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YGL230C	YGL230C	444 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	MBB1	YJL199C	327 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	CCE1	YKL011C	1062 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	COA4	YLR218C	453 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	RAS1	YOR101W	930 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	RPB8	YOR224C	441 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	TPK2	YPL203W	1143 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	RGC1	YPR115W	3252 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YPS6	YIR039C	1614 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	SKN7	YHR206W	1869 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	TCP1	YDR212W	1680 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YDR089W	YDR089W	2610 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	DET1	YDR051C	1005 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	DPP1	YDR284C	870 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	SRB7	YDR308C	423 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YGL242C	YGL242C	546 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	RGI2	YIL057C	495 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	YMR087W	YMR087W	855 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	PEX15	YOL044W	1152 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	FAA2	YER015W	2235 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRD1	Q06106	RAD5	YLR032W	3510 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	STP1	YDR463W	1560 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	TOP1	YOL006C	2310 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	PET100	YDR079W	336 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YDR149C	YDR149C	708 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	RPL30	YGL030W	318 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	MPS2	YGL075C	1164 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YHR097C	YHR097C	1101 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	DLS1	YJL065C	504 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SUI2	YJR007W	915 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	RPL17A	YKL180W	555 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	RNH203	YLR154C	333 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	BUR2	YLR226W	1188 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YLR307C-A	YLR307C-A	264 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	MIC27	YNL100W	705 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	MRPL17	YNL252C	846 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YOR238W	YOR238W	912 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	ARP4	YJL081C	1470 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	CHO2	YGR157W	2610 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SKP2	YNL311C	2292 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	DOA4	YDR069C	2781 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	VMA7	YGR020C	357 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	THP2	YHR167W	786 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YKL131W	YKL131W	522 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	RPL15A	YLR029C	615 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SRT1	YMR101C	1032 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	CMD1	YBR109C	444 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SLY41	YOR307C	1362 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SPT14	YPL175W	1359 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	DRS2	YAL026C	4068 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	POL3	YDL102W	3294 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	MIG1	YGL035C	1515 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	CBS2	YDR197W	1170 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	FRQ1	YDR373W	573 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	DOG2	YHR043C	741 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SVP26	YHR181W	687 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	COQ9	YLR201C	783 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	BET5	YML077W	480 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YBR116C	YBR116C	528 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SIZ1	YDR409W	2715 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	RUB1	YDR139C	234 nt		3.49	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms