Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms