Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RELAQ04206 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RELAQ04206 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RELAQ04206 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RELAQ04206 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RELAQ04206 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RELAQ04206 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RELAQ04206 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RELAQ04206 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RELAQ04206 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RELAQ04206 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RELAQ04206 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RELAQ04206 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RELAQ04206 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RELAQ04206 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RELAQ04206 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RELAQ04206 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RELAQ04206 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RELAQ04206 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RELAQ04206 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RELAQ04206 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms