Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID5AQ03989 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms