Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC4Q03721 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms