Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms