Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms