Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms