Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLCB3Q01970 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms