Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAP1Q01518 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAP1Q01518 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms