Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms