Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms