Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms