Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EFNB1P98172 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNB1P98172 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms