Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG7P83436 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG7P83436 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG7P83436 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG7P83436 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG7P83436 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG7P83436 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG7P83436 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG7P83436 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG7P83436 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG7P83436 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms