Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms