Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMF1P82094 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMF1P82094 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMF1P82094 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMF1P82094 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMF1P82094 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMF1P82094 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TMF1P82094 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMF1P82094 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMF1P82094 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMF1P82094 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMF1P82094 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMF1P82094 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMF1P82094 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMF1P82094 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMF1P82094 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMF1P82094 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMF1P82094 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMF1P82094 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMF1P82094 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMF1P82094 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMF1P82094 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMF1P82094 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMF1P82094 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMF1P82094 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TMF1P82094 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMF1P82094 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TMF1P82094 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMF1P82094 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMF1P82094 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMF1P82094 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMF1P82094 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMF1P82094 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMF1P82094 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMF1P82094 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMF1P82094 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMF1P82094 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMF1P82094 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms