Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFI35P80217 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFI35P80217 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFI35P80217 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFI35P80217 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFI35P80217 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFI35P80217 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFI35P80217 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFI35P80217 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFI35P80217 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFI35P80217 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFI35P80217 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFI35P80217 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFI35P80217 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFI35P80217 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFI35P80217 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFI35P80217 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFI35P80217 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFI35P80217 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFI35P80217 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFI35P80217 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFI35P80217 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFI35P80217 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFI35P80217 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFI35P80217 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms