Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP1P78357 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms