Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC5P78333 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC5P78333 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC5P78333 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC5P78333 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC5P78333 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC5P78333 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC5P78333 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC5P78333 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC5P78333 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC5P78333 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC5P78333 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC5P78333 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPC5P78333 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC5P78333 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC5P78333 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC5P78333 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC5P78333 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC5P78333 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC5P78333 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC5P78333 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC5P78333 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC5P78333 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC5P78333 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC5P78333 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms