Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTA2P62736 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms