Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2HP62256 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms