Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms