Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms