Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms