Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP4BP1P59074 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms