Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP11P59045 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP11P59045 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP11P59045 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP11P59045 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP11P59045 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP11P59045 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP11P59045 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP11P59045 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP11P59045 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP11P59045 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP11P59045 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms