Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CABP4P57796 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CABP4P57796 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CABP4P57796 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CABP4P57796 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CABP4P57796 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CABP4P57796 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CABP4P57796 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CABP4P57796 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CABP4P57796 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CABP4P57796 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CABP4P57796 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CABP4P57796 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CABP4P57796 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABP4P57796 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABP4P57796 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABP4P57796 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABP4P57796 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABP4P57796 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABP4P57796 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABP4P57796 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABP4P57796 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABP4P57796 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABP4P57796 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABP4P57796 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABP4P57796 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABP4P57796 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CABP4P57796 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CABP4P57796 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CABP4P57796 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CABP4P57796 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CABP4P57796 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CABP4P57796 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABP4P57796 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CABP4P57796 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CABP4P57796 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CABP4P57796 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CABP4P57796 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CABP4P57796 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms