Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms